自考学历不被承认的原因有两种，一种是部分事业单位的硬性规定就是不认可自考学历;另一种是通过自学所获得的证书不属于自考学历，而是其他学历。自考学历属于国民教育系列，受国家认可且在学信网可查到电子档案，和普通高等教育学历有着一样的法律效力。并且自考是成人教育中考试难度最高的学习形式，含金量也最高。
自考学历不承认的原因：
一、部分事业单位的硬性规定
在部分事业单位的岗位招聘学历要求中，考生必须拥有全日制普通高等教育院校的大专及以上学历才能报考，而自考学历属于成人教育，是非全日制学历。当然，并不是所有事业单位都有这个规定，有些单位是考生只要拥有属于国民教育系列大专及以上的学历就能报考，而自考学历属于国民教育系列。考生应以事业单位的招聘简章为准。
二、通过自学所获得的学历不是自考学历
由民办高等学校、党校、军事院校所颁发的学历证书不属于自考学历，这些院校是非国民教育，所颁发的学历证书不属于国民教育系列，没有教育部的授权，不被国家承认，学信网也查不到电子档案。